Le programme officiel comporte quatre sous-programmes:
1) un sous-programme élaboré pour le département de la Guadeloupe et qui porte sur deux actions:
- les structures d'évaluation, d'analyses et de diagnostics des risques phytosanitaires,
- la lutte contre les principaux ennemis des cultures;
2) un sous-programme élaboré pour le département de la Guyane et qui porte sur trois actions:
- les structures d'évaluation, d'analyses et de diagnostics des risques phytosanitaires,
- le développement de méthodes de lutte contre les principaux ennemis des cultures,
- enquête et lutte contre les ravageurs et maladies du riz;
3) un sous-programme élaboré pour le département de la Réunion et qui porte sur trois actions:
- les structures d'évaluation, d'analyses et de diagnostics des risques phytosanitaires,
- le développement de méthodes de lutte contre les principaux ennemis des cultures,
- enquête sur les mouches des fruits;
4) un sous-programme élaboré pour le département de la Martinique et qui porte sur trois actions:
- les structures d'évaluation, d'analyses et de diagnostics des risques phytosanitaires,
- la lutte contre les principaux ennemis des cultures,
- le développement de la lutte intégrée.