1. Méthodes de piégeage, d’isolement et d’extraction, notamment:
— Méthodes par étalement
— Méthodes d’extraction de l’organisme cible à partir de la matrice
2. Méthodes morphologiques et morphométriques
3. Méthodes d’évaluation de la pathogénicité
4. Méthodes biochimiques, notamment:
— Électrophorèse enzymatique
— Électrophorèse inverse sur gel de polyacrylamide (R-PAGE)
5. Méthodes fondées sur l’empreinte, notamment:
— Profilage des protéines
— Profilage des acides gras
— Profilage ADN
— Spectrométrie de masse de type MALDI-TOF
6. Méthodes moléculaires, notamment:
— Amplification en chaîne par polymérase classique (PCR)
— Amplification en chaîne par polymérase en temps réel (PCR en temps réel)
— Amplification isotherme médiée par les boucles (LAMP)
— Amplification par recombinase-polymérase (RPA)
— Séquençage de nouvelle génération (NGS)
— Barcoding ADN
7. Méthodes sérologiques, notamment:
— Immunofluorescence
— Dosage d’immunoabsorption par enzyme liée (test ELISA)
— Immuno-microscopie électronique