1. Le directeur du Laboratoire national de dépistage du dopage est nommé par arrêté du ministre chargé des sports.
2. Il assure la direction scientifique, administrative et financière de l'établissement. Il est assisté dans la gestion administrative et financière par un secrétaire général.
3. Il prépare et exécute les délibérations du conseil d'administration et veille au bon fonctionnement de l'établissement.
4. Il est l'ordonnateur des recettes et des dépenses.
5. Il prépare les projets de programmes de recherche avec le concours du comité d'orientation scientifique ;
6. Il représente l'établissement en justice et dans tous les actes de la vie civile. Il passe tous actes, contrats ou marchés, y compris les conventions mentionnées au dernier alinéa de l'article 2. Il procède à tous dépôts et acquisitions de droits de propriété intellectuelle.
7. Il a autorité sur l'ensemble des personnels.
8. Il peut déléguer sa signature au secrétaire général ainsi qu'aux autres agents titulaires de l'établissement appartenant à des corps de catégorie A.